Roche cobas s 201 system Manual do usuário
- Tipo
- Manual do usuário
02/2008, versão 1.0 1.1
Algoritmos de
Pooling 1
Descrição geral
O sistema cobas s 201 pode ser configurado para criar pools grandes. As
pools grandes contêm alíquotas iguais de n amostras de dador.
n pode ser 24, 48 ou 96.
As pools grandes só são utilizadas para testes MPX.
Pooling Primária
Uma Pooling Primária para pools grandes é um processo de dois passos:
1 Execução da Placa - Pool n (MPX): São criadas pools provisórias, cada
uma contendo alíquotas de 12 amostras de dador, nos poços da Placa
Intermédia. Na configuração predefinida, o sistema cobas s 201 também
prepara uma Placa Biblioteca para guardar uma alíquota de cada tubo de
dador, para o caso de serem necessários testes secundários.
2 Execução do Batch - Pool n (MPX): São pipetados controlos e, em
seguida, alíquotas iguais dos poços da Placa Intermédia são combinadas
em tubos-S para criar pools que contêm 24 (dois poços), 48 (quatro
poços) ou 96 (oito poços) amostras.
Pooling Secundária
São necessários testes suplementares (secundários) se os resultados de
teste de uma Pool Primária grande forem inválidos ou reactivos. Estão
disponíveis as seguintes opções de Pooling Secundária:
• Execução do Batch de Repetição - Pool n (MPX): O passo 2 da
execução da Pooling Primária é repetido para testar novamente as
amostras de dador de pools com resultados de teste inválidos.
• Pooling Bidimensional (2D) (MPX): É criada uma matriz de pools
de dador, em que cada amostra de dador é pipetada para um
conjunto único de duas pools separadas, de tal modo que se essas
duas pools forem reactivas, os resultados podem ser atribuídos a
uma amostra de dador específica.
• Pooling de Confirmação (MPX): São criadas pools de amostra
única para confirmar amostras de dador reactivas suspeitas e as
amostras restantes são colocadas em pools de quatro, seis, onze ou
doze amostras para confirmar resultados de testes não reactivos.
• Pooling de Resolução (MPX): São preparadas pools de amostras
únicas para testar individualmente amostras de pools inválidas ou
reactivas.
1.2 02/2008, versão 1.0
Percurso do fluxo de trabalho
O percurso predefinido do fluxo de trabalho para testar amostras em
Pools Grandes é apresentado na Figura 1.1.
Figura 1.1
Percurso do fluxo de trabalho para Pools Grandes
Erro
Não-reactivo
Reactivo
OK
Resultado
Estado de
pipetagem
Não
Sim
Pools Primárias
de 24, 48 ou 96
(Execução do
Batch)
Execução de
Batch de
Repetição
Complete,
Non-Reactive
OK
Aspirado
Erro
Estado de
pipetagem
Inválido
Pools Primárias
de 24, 48 ou 96
(Execução de
Placa)
Pool Curta
Pooling de
Confirmação
Não
Inválido
Complete,
Non-Reactive
Não-reactivo
Resultado
Complete,
Non-Reactive
Complete,
Reactive
Reactivo
Tamanho
da Pool
Igual a 1
Sim
Excluir dadores
com teste
positivo externo
Maior do que 1
Pooling de
Resolução
Não-reactivo
Inválido
Complete,
Non-Reactive
Complete,
Reactive
Reactivo
Resultado
Outro
Pooling 2D
Não-reactivo
Batch inválido
Avaliação de
Matriz 2D
Algoritmos de Pooling
02/2008, versão 1.0 1.3
Os percursos na Figura 1.1 são atribuídos pelo sistema. O
administrador do laboratório pode optar por alterar o percurso
predefinido do fluxo de trabalho e utilizar por exemplo uma Pooling
de Resolução para testar novamente as amostras de pools reactivas ou
inválidas (consulte Alterar o pedido de Pooling no Manual de
Referência de hardware e software do sistema cobas s 201).
Execução de Placa
A Execução de Placa é o primeiro passo do processo de Pooling Primária.
As amostras que são pipetadas com êxito para uma Placa Intermédia
durante a Execução de Placa são programadas para uma Execução de
Batch, o segundo passo do processo de Pooling Primária.
As amostras com erros de pipetagem são programadas para uma Pooling
de Resolução (Figura 1.19) se tiverem sido aspiradas com êxito, caso
contrário poderão ser escolhidas para outra Execução de Placa
(Figura 1.2).
Figura 1.2
Execução de Placa
Pooling de
Resolução
Pools Primárias
de 24, 48 ou 96
(Execução de
Placa)
Pools Primárias
de 24, 48 ou 96
(Execução do
Batch)
Não
Sim
Aspirado
Erro
OK
Estado de
pipetagem
1.4 02/2008, versão 1.0
Execução de Batch
A Execução de Batch é o segundo passo do processo de Pooling Primária.
As amostras que são pipetadas com êxito para uma Pool Grande durante a
Execução de Batch são testadas em relação à presença do analito do
rastreio (Figura 1.3).
• Todas as amostras de dador na pool são indicadas como
não-reactivas se a pool for não-reactiva.
• Se a pool for reactiva e contiver as 96, 48 ou 24 amostras esperadas,
então as amostras de dador da pool são programadas para Pooling
2D (Figura 1.4).
• Se a pool for reactiva mas contiver menos do que as 96, 48 ou 24
amostras planeadas (devido a erros de pipetagem), então as
amostras de dador da Pool Curta são programadas para Pooling de
Confirmação (Figura 1.18).
• É programada outra Execução de Batch (uma Execução de Batch de
Repetição) se o resultado de teste for inválido.
As amostras com erros de pipetagem são programadas para uma Pooling
de Resolução.
Figura 1.3
Execução de Batch
Pooling de
Resolução
Erro
Não-reactivo
Reactivo
OK
Inválido
Resultado
Estado de
pipetagem
Pool Curta
Não
Sim
Pools Primárias de
24, 48 ou 96
(Execução do
Batch)
Pooling 2D
Execução de
Batch de
Repetição
Pooling de
Confirmação
Complete,
Non-Reactive
Algoritmos de Pooling
02/2008, versão 1.0 1.5
Pooling 2D
É programada uma Pooling 2D se o resultado de teste de uma Pool
Primária ou uma Pool de Batch de Repetição for reactivo e a pool contiver
o complemento inteiro (24, 48 ou 96) de amostras de dador.
O administrador do laboratório também pode optar por utilizar
uma Pooling 2D em vez de uma Execução de Batch de Repetição
para testar novamente uma Pool Primária inválida.
A Pooling 2D cria uma matriz de pools de dador em que cada amostra de
dador da pool original é pipetada para um conjunto único de duas pools
separadas. Os resultados das duas pools são avaliados para determinar se a
amostra de dador é não-reactiva ou se é necessária uma Pooling de
Resolução (Figura 1.4).
O número de pools na matriz 2D depende do tamanho da Pool Primária
inicial:
Figura 1.4
Pooling 2D
Pooling 2D
Batch inválido
Avaliação de
Matriz 2D
Pooling de
Resolução
Complete,
Non-Reactive
Não-reactivo
Outro
Tamanho da Pool
Primária
Número de Pools 2D M x N
24 4 pools de 6 amostras
6 pools de 4 amostras
4 x 6
48 8 pools de 6 amostras
6 pools de 8 amostras
8 x 6
96 Dois batches, cada um
contendo:
8 pools de 6 amostras
6 pools de 8 amostras
8 x 6
(duas matrizes)
1.6 02/2008, versão 1.0
Avaliação de matriz 2D
A avaliação da matriz da pooling 2D MxN baseia-se no exame dos
resultados horizontais da pool, P
H
(M), os resultados verticais da pool
P
V
(N), e a interpretação dos resultados de dador na intersecção, (R
h,
R
v
).
Os diagramas das páginas seguintes representam diferentes cenários de
matrizes de pooling 2D. Os círculos (ilustrados no exterior da matriz)
contêm os resultados de teste da pool (tubo-S). Os quadrados (ilustrados
no interior da matriz) são os resultados de dador que são interpretados
com base nos resultados de teste das duas pools nas quais a amostra de
dador foi testada.
Em todos os exemplos é utilizada uma matriz 6x4.
Figura 1.5
Perspectiva geral da avaliação da pooling 2D
Resultado horizontal
Resultado vertical
A intersecção representa uma amostra de dador
Algoritmos de Pooling
02/2008, versão 1.0 1.7
Exemplo 1
Todas as pools 2D são testadas como sendo não-reactivas (-). Todas as
intersecções (-,-) são interpretadas como sendo não-reactivas. Todas as
amostras de dador são indicadas como Complete, Non-Reactive
(Figura 1.6).
Exemplo 2
Uma pool 2D horizontal e uma vertical são testadas como sendo reactivas
(+). Todas as outras pools 2D são testadas como sendo não-reactivas (-). A
amostra de dador na intersecção das pools reactivas (+,+) é programada
para uma Pooling de Resolução. Todas as restantes intersecções [(-,-),
(+,-), (-,+)] são interpretadas como sendo não-reactivas, e estas amostras
de dador são marcadas como Complete, Non-Reactive (Figura 1.7).
Figura 1.6
Exemplo 1 de matriz 2D
Figura 1.7
Exemplo 2 de matriz 2D
Programada para uma
Pooling de Resolução
1.8 02/2008, versão 1.0
Exemplo 3
Uma pool 2D horizontal e uma vertical são testadas como sendo inválidas
(I). Todas as outras pools 2D são testadas como sendo não-reactivas (-).
A amostra de dador na intersecção das pools inválidas (I,I) é programada
para uma Pooling de Resolução. Todas as restantes intersecções [(-,-), (I,-),
(-,I)] são interpretadas como sendo não-reactivas, e estas amostras de dador
são marcadas como Complete, Non-Reactive (Figura 1.8).
Exemplo 4
Uma pool 2D horizontal é testada como sendo reactiva (+) e uma pool 2D
vertical é testada como sendo inválida (I) (ou vice-versa). Todas as outras
pools 2D são testadas como sendo não-reactivas (-). A amostra de dador
na intersecção da pool reactiva e da pool inválida [(+,I) ou (I,+)] é
programada para uma Pooling de Resolução. Todas as restantes
intersecções [(-,-), (+,-), (-,+), (-,I), (I,-)] são interpretadas como sendo
não-reactivas, e estas amostras de dador são marcadas como Complete,
Non-Reactive (Figura 1.9).
Figura 1.8
Exemplo 3 de matriz 2D
Programada para uma
Pooling de Resolução
Figura 1.9
Exemplo 4 de matriz 2D
Programada para uma
Pooling de Resolução
Algoritmos de Pooling
02/2008, versão 1.0 1.9
Exemplo 5
Uma pool 2D horizontal e duas pools 2D verticais (ou vice-versa) são
testadas como sendo reactivas (+). Todas as outras pools 2D são testadas
como sendo não-reactivas (-). As amostras de dador nas intersecções
(+,+) são programadas para Pooling de Resolução. Todas as restantes
intersecções [(-,-), (+,-), (-,+)] são interpretadas como sendo não-
reactivas, e estas amostras de dador são marcadas como Complete,
Non-Reactive (Figura 1.10).
Exemplo 6
Uma pool 2D horizontal e uma vertical são testadas como sendo reactivas
(+). Uma pool 2D (em qualquer direcção) é testada como sendo inválida
(I). Todas as outras pools 2D são testadas como sendo não-reactivas (-).
As amostras de dador nas intersecções [(+,+), (+,I), (I,+)] são
programadas
para
Pooling de Resolução
. Todas as restantes
intersecções [(-,-), (+,-), (-+),
(-,I), (I,-)] são interpretadas como sendo
não-reactivas, e estas amostras de dador são marcadas como Complete,
Non-Reactive (Figura 1.11).
Figura 1.10
Exemplo 5 de matriz 2D
Programadas para uma
Pooling de Resolução
Figura 1.11
Exemplo 6 de matriz 2D
Programadas para uma
Pooling de Resolução
1.10 02/2008, versão 1.0
Exemplo 7
Duas pools 2D verticais são testadas como sendo reactivas (+) e uma pool
2D horizontal é testada como sendo inválida (I) (ou vice-versa). Todas as
outras pools 2D são testadas como sendo não-reactivas (-). As amostras de
dador nas intersecções [(I,+), (+,I)] são programadas para Pooling de
Resolução. Todas as restantes intersecções [(-,-), (-,+), (+,-), (-,I), (I,-)]
são interpretadas como sendo não-reactivas, e estas amostras de dador são
marcadas como Complete, Non-Reactive (Figura 1.12).
Exemplo 8
Todas as pools 2D são testadas como sendo inválidas (I) ou são rejeitadas
pelo utilizador. A grelha inteira é inválida. Todas as amostras de dador são
programadas para Pooling 2D (de Repetição) (Figura 1.13).
Uma Pool 2D de Repetição só está disponível quando todas as pools
2D são inválidas.
Figura 1.12
Exemplo 7 de matriz 2D
Programadas para uma
Pooling de Resolução
Figura 1.13
Exemplo 8 de matriz 2D
Algoritmos de Pooling
02/2008, versão 1.0 1.11
Exemplo 9
Uma pool 2D horizontal é testada como sendo reactiva (+). Não há nenhuma
pool 2D vertical correspondente
que seja testada como sendo reactiva. Todas
as outras pools 2D são testadas como sendo não-reactivas (-).
As amostras de
dador nas intersecções (+,-) são programadas para Pooling de Resolução.
Todas as restantes intersecções, (-,-), são interpretadas como sendo não-
reactivas, e estas amostras de dador são marcadas como Complete,
Non-Reactive (Figura 1.14).
Exemplo 10
Uma pool 2D vertical é testada como sendo reactiva (+). Não há nenhuma
pool 2D horizontal correspondente que seja testada como sendo reactiva.
Todas as outras pools 2D são testadas como sendo não-reactivas (-). As
amostras de dador nas intersecções (-,+) são programadas para Pooling de
Resolução. Todas as restantes intersecções, (-,-), são interpretadas como
sendo não-reactivas, e estas amostras de dador são marcadas como
Complete, Non-Reactive (Figura 1.15).
Figura 1.14
Exemplo 9 de matriz 2D
Programadas para uma
Pooling de Resolução
Figura 1.15
Exemplo 10 de matriz 2D
Programadas para uma
Pooling de Resolução
1.12 02/2008, versão 1.0
Exemplo 11
Uma pool 2D horizontal é testada como sendo inválida (I). Não há
nenhuma pool 2D vertical correspondente que seja testada como sendo
inválida. Todas as outras pools 2D são testadas como sendo não-reactivas
(-). As amostras de dador nas intersecções (I,-) são programadas para
Pooling de Resolução. Todas as restantes intersecções, (-,-), são
interpretadas como sendo não-reactivas, e estas amostras de dador são
marcadas como Complete, Non-Reactive (Figura 1.16).
Exemplo 12
Uma pool 2D vertical é testada como sendo inválida (I). Não há nenhuma
pool 2D horizontal correspondente que seja testada como sendo inválida.
Todas as outras pools 2D são testadas como sendo não-reactivas (-). As
amostras de dador nas intersecções (-,I) são programadas para Pooling de
Resolução. Todas as restantes intersecções, (-,-), são interpretadas como
sendo não-reactivas, e estas amostras de dador são marcadas como
Complete, Non-Reactive (Figura 1.17).
Figura 1.16
Exemplo 11 de matriz 2D
Programadas para uma
Pooling de Resolução
Figura 1.17
Exemplo 12 de matriz 2D
Programadas para uma
Pooling de Resolução
Algoritmos de Pooling
02/2008, versão 1.0 1.13
Pooling de Confirmação
É programada uma Pooling de Confirmação em vez de uma Pooling 2D,
se uma Pool Primária reactiva contiver um número de amostras inferior
ao esperado devido a erro(s) de pipetagem.
O administrador do laboratório também pode optar por utilizar
uma Pooling de Confirmação em vez da Pooling 2D. No entanto,
uma vez iniciada a Pooling 2D, o algoritmo da Pooling 2D tem de
ser seguido até à sua conclusão.
A Pooling de Confirmação permite que algumas amostras sejam testadas
individualmente (por ex., para confirmar resultados de testes de serologia
positivos). As amostras de dador potencialmente reactivas são
identificadas antes da Pooling de Confirmação se iniciar (consulte o
separador Excluir dadores no Manual de Referência de hardware e software
do sistema cobas s 201). Essas amostras são pipetadas para pools de
amostras únicas. As amostras restantes são pipetadas para pools mais
pequenas. Todas as pools são testadas para determinar a presença do
analito de rastreio (Figura 1.18).
• A amostra de dador é indicada como não-reactiva se uma pool de
amostra única for não-reactiva.
• Todas as amostras de dador na pool são indicadas como
não-reactivas se uma pool de várias amostras for não-reactiva.
• A amostra de dador é indicada como reactiva se uma pool de
amostra única for reactiva.
• Todas as amostras de dador na pool são programadas para testes
numa Pooling de Resolução (Figura 1.19) se uma pool de várias
amostras for reactiva.
• Uma Pooling de Confirmação pode ser repetida se o resultado de
teste for inválido.
Figura 1.18
Pooling de Confirmação
Pooling de
Resolução
Pooling de
Confirmação
Complete,
Non-Reactive
Não-reactivo
Resultado
Complete,
Reactive
Reactivo
Tamanho
da Pool
Igual a 1
Excluir dadores
com teste positivo
externo
Maior do que 1
Inválido
1.14 02/2008, versão 1.0
Pooling de Resolução
É programada uma Pooling de Resolução para amostras com erros de
pipetagem durante a execução da Pooling Primária e para amostras numa
Pool de Confirmação ou uma Pool 2D reactiva. Cada Pool de Resolução
contém uma alíquota de uma amostra de dador única.
O administrador do laboratório também pode optar por utilizar
uma Pooling de Resolução para resolver resultados inválidos ou
reactivos.
As Pools de Resolução são testadas para determinar a presença do(s)
analito(s) de rastreio (Figura 1.19).
• A amostra de dador é indicada como não-reactiva se a Pool de
Resolução for não-reactiva.
• A amostra de dador é indicada como reactiva se a Pool de
Resolução for reactiva.
• A amostra de dador tem de ser incluída noutra Pool de Resolução
se a Pool de Resolução for inválida.
Figura 1.19
Pooling de Resolução
Pooling de
Resolução
Não-reactivo
Inválido
Complete,
Non-Reactive
Complete,
Reactive
Reactivo
Resultado
-
1
-
2
-
3
-
4
-
5
-
6
-
7
-
8
-
9
-
10
-
11
-
12
-
13
-
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