Roche uPath HER2 (4B5) image analysis for Breast Algorithm Manual do usuário
- Tipo
- Manual do usuário
Guia do algoritmo de análise de
imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Índice
Introdução 1
Resumo e explicação do algoritmo 2
Utilização prevista 3
Aplicação do produto 3
Objetivo do Guia do algoritmo 3
Significado clínico 4
Princípios de teste 5
Limitações 6
Características da rede 7
Proteção de dados 8
Fluxo de trabalho de utilização do algoritmo uPath HER2 (4B5) 9
Fluxo de trabalho do patologista 11
Características de coloração 18
Avaliação do anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5) 18
Avaliação da coloração do algoritmo uPath HER2 (4B5) 18
Caraterísticas de desempenho 30
Comparação de métodos 30
Estudos de reprodutibilidade de patologista 31
Estudos de reprodutibilidade de digitalizadores 32
Resolução de problemas 33
Referências 37
Introdução
O Roche uPath enterprise software (uPath enterprise software)
com o algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2
(4B5) (algoritmo uPath HER2 (4B5)) é um sistema de software
concebido para ajudar na avaliação semiquantitativa da
expressão da proteína do recetor 2 do fator de crescimento
epidérmico humano (HER2) em secções histológicas coradas
imuno-histoquimicamente a partir de tecidos normais e
neoplásicos fixados em formol e impregnados em parafina (FFPE).
O uPath enterprise software é uma solução integral de software
para patologia digital que permite aos laboratórios de patologia
adquirir, gerir, visualizar, analisar, partilhar e gerar relatórios
sobre imagens digitais de espécimes patológicos. Utilizando o
uPath enterprise software, o patologista pode visualizar imagens
digitais em diversas ampliações, adicionar anotações, efetuar
medições de secções de tecido, realizar análises de imagens e
gerar relatórios.
Nota: o algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2
(4B5) é uma metodologia auxiliar assistida por computador
que visa ajudar na aquisição e medição de imagens a partir
de lâminas de microscópio de espécimes de tecido mamário
que foram sujeitos a coloração por imuno-histoquímica, com
vista a verificar a presença da proteína HER2. Para assegurar a
validade das pontuações da análise de imagem, o patologista
tem a responsabilidade de verificar a respetiva conformidade e
de utilizar controlos apropriados, conforme é especificado na
folha de métodos do anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5)
(disponível em dialog.roche.com).
1 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Resumo e explicação do algoritmo
No que diz respeito a aplicações de análise de imagem, o
patologista utiliza o uPath enterprise software para selecionar e
contornar uma ou mais regiões de interesse (ROI), podendo cada
ROI ser visualizada em várias ampliações e ser, seguidamente,
analisada pelo algoritmo uPath HER2 (4B5). É gerada uma
contagem do número total de células tumorais alvo e as
células tumorais são estratificadas em função de estarem ou
não coradas. As células coradas são estratificadas em função
da intensidade da coloração e da completude da coloração
da membrana. O algoritmo uPath HER2 (4B5) combina a
percentagem de coloração (coradas, não coradas), a intensidade
da coloração (fraca, média, forte) e a completude da coloração
(não coradas, parciais, completas) para gerar uma pontuação
de HER2 numa escala de 0 a 3+. O algoritmo uPath HER2 (4B5)
pode gerar uma pontuação para uma determinada ROI, ou uma
pontuação agregada para todas as ROI selecionadas nessa
lâmina. O patologista pode aceitar a pontuação fornecida pelo
algoritmo uPath HER2 (4B5) ou pode substituir essa pontuação
por uma pontuação diferente. O algoritmo uPath HER2 (4B5) não
faz interpretações independentes dos dados e, por isso, só deve
ser utilizado por um patologista qualificado, em conjunto com um
exame histológico, a informação clínica relevante e os controlos
adequados. O algoritmo uPath HER2 (4B5) foi concebido e está
indicado para auxiliar o patologista na avaliação da expressão da
proteína HER2 em espécimes de tecido mamário corados com o
anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5).
2 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Aplicação do produto
O algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2
(4B5) está indicado para auxiliar o patologista na deteção
semiquantitativa da proteína HER2 em tecido mamário
neoplásico fixado em formol e impregnado em parafina.
Quando utilizado com o VENTANA anti-HER2/neu (4B5) Rabbit
Monoclonal Primary Antibody (anticorpo VENTANA anti-HER2/
neu (4B5)) está indicado como auxiliar na avaliação de pacientes
de cancro da mama em cujo tratamento esteja a ser considerada
a administração de Herceptin
®
(trastuzumab), KADCYLA
®
(ado-trastuzumab emtansina) ou PERJETA
®
(pertuzumab).
Nota: o algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2
(4B5) é uma metodologia auxiliar assistida por computador
que visa ajudar na aquisição e medição de imagens a partir de
lâminas de microscópio de espécimes de tecido mamário que
foram sujeitos a coloração por imuno-histoquímica, com vista a
verificar a presença da proteína HER2. Para assegurar a validade
das pontuações da análise de imagem, o patologista tem a
responsabilidade de verificar a respetiva conformidade e de
utilizar controlos apropriados, conforme é especificado na folha
de métodos do anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5).
Este algoritmo destina-se ao diagnóstico in vitro (IVD).
Utilização prevista
Objetivo do Guia do algoritmo
Este guia do algoritmo uPath HER2 (4B5) (guia do algoritmo)
destina-se a:
• Fornecer informações de referência sobre a utilização prevista
do algoritmo uPath HER2 (4B5), bem como sobre os princípios e
as limitações do teste.
• Definir os materiais, meios informáticos, segurança de dados e
requisitos de rede necessários.
• Apresentar instruções passo a passo para a execução do
algoritmo uPath HER2 (4B5).
• Disponibilizar imagens fotográficas que ilustrem a forma como o
algoritmo uPath HER2 (4B5) deve ser utilizado.
• Disponibilizar uma ferramenta que facilite a utilização do
algoritmo uPath HER2 (4B5) em secções de tecido mamário
FFPE coradas com o anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5).
• Disponibilizar imagens exemplificativas de casos complexos,
de modo a explicar a forma como o algoritmo uPath HER2 (4B5)
pode ser utilizado na respetiva avaliação.
• Apresentar as características de desempenho do algoritmo
uPath HER2 (4B5).
3 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Significado clínico
O cancro da mama é o carcinoma mais comum que ocorre
na mulher e a segunda causa de morte relacionada com
o cancro.
1,2
Na América do Norte, a probabilidade de uma
mulher ter cancro da mama é de uma em cada oito.
1
A deteção
precoce e a utilização de terapêuticas apropriadas podem
afetar significativamente a sobrevivência global.
3,4
Pequenas
amostras de tecido podem ser utilizadas facilmente em
imuno-histoquímica (IHQ) de rotina, tornando esta técnica,
em combinação com anticorpos que detetam antigénios
importantes para a interpretação de carcinomas, uma
ferramenta eficaz para os patologistas, em termos de diagnóstico
e prognóstico da doença. Atualmente, a oncoproteína HER2
é um marcador importante no cancro da mama.
5,6,7,8
As
farmacoterapias com Herceptin (trastuzumab), KADCYLA
(ado-trastuzumab emtansina) e PERJETA (pertuzumab) têm
demonstrado benefícios em alguns pacientes com carcinoma
da mama porque impedem (chegando mesmo, em alguns casos,
a reverter) o crescimento do cancro.
5,6,7,8,9
Estes fármacos são
anticorpos monoclonais humanizados que se ligam à proteína
HER2 nas células cancerígenas.
5,8,9,10
O diagnóstico in vitro para avaliação do estado de HER2 em
pacientes com cancro da mama é um fator importante para ajudar
o médico a determinar a terapêutica direcionada para HER2.
5,6,7,8
O anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5) destina-se a ser
utilizado na deteção baseada em IHQ da expressão da proteína
HER2 no cancro da mama. O algoritmo uPath HER2 (4B5) funciona
como um acessório do anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5)
para ajudar na avaliação de pacientes com cancro da mama em
cujo tratamento esteja a ser considerada a administração de
Herceptin (trastuzumab), KADCYLA (ado-trastuzumab emtansina)
ou PERJETA (pertuzumab).
4 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Princípios de teste
Critérios de intensidade e padrão de coloração de
membranas celulares na pontuação do algoritmo uPath
HER2 (4B5):
Padrão de coloração Pontuação Avaliação da
coloração de
HER2
Não é observada coloração da
membrana
0 Negativo
Coloração ténue e parcial da
membrana em qualquer proporção
das células cancerígenas
1+ Negativo
Coloração completa da membrana
de fraca a moderada, >10% das
células cancerígenas
2+ Equívoca*
Coloração completa intensa da
membrana, >10% das células
cancerígenas
3+ Positivo
*Reflexo recomendado para ISH
O uPath enterprise software com o algoritmo uPath HER2 (4B5)
recorre a técnicas de análise de imagem para obter uma
pontuação de HER2.
O algoritmo uPath HER2 (4B5) utiliza parâmetros predefinidos
para pontuar as imagens de tecido coradas com o anticorpo
VENTANA anti-HER2/neu (4B5).
Passos envolvidos na análise de imagem:
• Deteção de células em toda a imagem.
• Classificação das células como células tumorais ou células de
outro tipo.
• Identificação da membrana corada e estratificação da
membrana em categorias: coloração parcial ou completa e
intensidade de coloração fraca, média ou forte.
• Cálculo da pontuação de HER2 combinando a classificação
das células, a intensidade da coloração e a classificação da
membrana.
Identificação de células tumorais pelo algoritmo de
análise de imagens HER2 e cálculo da pontuação:
• O algoritmo uPath HER2 (4B5) identifica as células tumorais
utilizando cor, intensidade, dimensão e características
morfológicas.
• As células tumorais identificadas são classificadas como
coradas utilizando a membrana detetada e limiares
predefinidos.
• Para calcular a pontuação de HER2, o algoritmo uPath HER2
(4B5) utiliza as células coradas identificadas e estratifica-as em
função da intensidade e completude da coloração.
5 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
O algoritmo uPath HER2 (4B5) foi concebido para funcionar com
o anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5). A qualidade dos
testes depende da qualidade e da exatidão da imagem obtida da
lâmina corada IHQ e da imagem subsequente que é analisada.
O patologista deve validar a execução da coloração do anticorpo
VENTANA anti-HER2/neu (4B5) através de um exame das
lâminas de controlo de HER2 feito utilizando um microscópio
manual, a fim de verificar se foram obtidos os resultados
previstos, antes de as imagens das lâminas serem aceites no
uPath enterprise software para análise.
Têm de ser seguidas as recomendações do fabricante do
anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5), incluindo a utilização
de todos os materiais de controlo da qualidade positivo e
negativo em cada execução de coloração. Se as lâminas de
controlo não forem aceitáveis após o exame com microscópio
manual, é necessário corar novamente os tecidos de forma a
obter resultados aceitáveis.
O patologista tem de seguir as recomendações de interpretação
que dizem respeito ao anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5).
O algoritmo uPath HER2 (4B5) foi concebido para ser utilizado
por um patologista qualificado, em conjunto com um exame
histológico, a informação clínica relevante e os controlos
adequados. Não foi concebido como ferramenta autónoma
e requer intervenção humana competente durante todo o
processo de análise.
O algoritmo uPath HER2 (4B5) pode gerar pontuações incorretas
se as imagens capturadas tiverem uma coloração anormal
(coloração nuclear, pigmentação, etc.).
O algoritmo uPath HER2 (4B5) pode rejeitar núcleos tumorais
alongados, independentemente do formato geral da célula. Por
esta razão, tumores que contenham grandes quantidades de
células com núcleos tumorais alongados poderão ter de ser
avaliados manualmente.
O algoritmo uPath HER2 (4B5) foi estudado, desenvolvido e
validado em: carcinomas invasivos lobulares, ductais, mucinosos,
medulares, papilares e micropapilares, assim como em algumas
lesões metastáticas.
O algoritmo uPath HER2 (4B5) não foi testado, ou a sua
segurança e eficácia não foram validadas, quando utilizado com
um computador pessoal (PC) a partir de casa.
O algoritmo uPath HER2 (4B5) identifica membranas coradas
com DAB de qualquer intensidade e completude. Utiliza um
limiar de ruído de 0,5% de todas as células tumorais para
pontuar um caso como 1+. Não segue as linhas de orientação
da folha de métodos quanto à utilização de um limiar de uma
célula para uma pontuação de 1+. Daqui podem resultar alguns
casos com muito poucas células a cuja coloração membranar é
atribuída uma pontuação de 0 e não de 1+. Este limiar de ruído foi
implementado para garantir que os casos que são verdadeiros
negativos são classificados como 0.
O algoritmo uPath HER2 (4B5) foi concebido para ser sensível à
cor castanha (coloração DAB), a fim de garantir que é detetada
coloração membranar, mesmo quando é muito ténue. Por
este motivo, pode pontuar incorretamente uma amostra de
tecido que contenha artefactos castanhos, como, por exemplo,
pigmentação, coloração de fundo em fibras musculares ou
quaisquer outros artefactos que tenham coloração castanha.
Existem ferramentas no uPath enterprise software que
permitirão ao patologista excluir áreas nestas circunstâncias.
Estas ferramentas são abordadas em mais detalhe na secção de
características de coloração.
O algoritmo uPath HER2 (4B5) foi concebido para ser sensível
aos casos 2+. Por este motivo, o algoritmo uPath HER2 (4B5)
pode pontuar incorretamente alguns casos 1+ como sendo 2+.
Concretamente, casos 1+ com ligeiramente menos de 10% de
células tumorais com coloração completa ou casos com uma
elevada quantidade de coloração citoplasmática de células
tumorais podem ser pontuados incorretamente como 2+. O
patologista poderá ter de substituir a pontuação nestes tipos
particulares de casos. A coloração citoplasmática é abordada em
mais detalhe na secção de características de coloração.
Limitações
6 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
7 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Características da rede
É recomendada uma ligação à rede de 1Gbps entre o uPath enterprise software e o sistema de gestão de imagens (Image
Management System, IMS).
Tabela 1. Especificações do servidor de análise de imagens Roche uPath para laboratórios de pequena dimensão.
Parâmetro Detalhes
Processador CPU @ 3,6 GHz
Número de núcleos 4
RAM 6 x 8GB (48GB)
Hyper-threading Desativado
Disco rígido 240 GB SSD
Sistema operativo Microsoft Windows Server 2016
Suporte de Virtual Machine (VM) Sim
Informações adicionais de VM O desempenho será diferente do dos servidores físicos devido à sobrecarga da VM.
Antivírus Symantec Endpoint Protection, Versão 12
Corrente 110V/220V, 800 Watts (2)
Portas 2 USB, placa de rede HPE Eth 10/25Gb
Fonte de alimentação ininterrupta Recomendado
Tabela 2. Especificações do servidor de análise de imagens Roche uPath para laboratórios de média a grande dimensão.
Parâmetro Detalhes
Processador CPU @ 3,6 GHz (2 processadores)
Número de núcleos 8 por processador/16 no total
RAM 12 x 8GB (96 GB)
Hyper-threading Desativado
Disco rígido 240 GB SSD (2x)
Sistema operativo Microsoft Windows Server 2016
Suporte de Virtual Machine (VM) Sim
Informações adicionais de VM O desempenho será diferente do dos servidores físicos devido à sobrecarga da VM.
Antivírus Symantec Endpoint Protection, Versão 12
Corrente 110V/220V, 800 Watts (2)
Portas 2 USB, placa de rede HPE Eth 10/25Gb
Fonte de alimentação ininterrupta Recomendado
O acesso não autorizado ao equipamento ou um software
malicioso pode ter como resultado a perda de dados ou a
indisponibilidade do equipamento.
Para evitar que o equipamento seja infetado por software
malicioso ou que ocorra um acesso não autorizado e utilização
indevida do equipamento, é essencial seguir as recomendações
que se seguem:
• Não instale nem execute qualquer outro software no
equipamento.
• Certifique-se de que os outros computadores e serviços na
rede estão devidamente protegidos e seguros contra software
malicioso e acesso não autorizado. Por exemplo, o sistema de
informações laboratoriais (LIS), a partilha de arquivo, a partilha
de cópias de segurança ou a assistência.
• Os clientes são responsáveis pela segurança da sua rede
de área local, especialmente pela proteção da rede contra
software e ataques maliciosos. Esta proteção pode incluir a
implementação de medidas como, por exemplo, uma firewall,
para proteger o dispositivo contra redes não controladas. Esta
proteção pode igualmente incluir medidas que assegurem que a
rede conectada não contém código malicioso.
• Restrinja o acesso físico ao equipamento e a toda a
infraestrutura de TI associada (computadores, cabos,
equipamento de rede e assim sucessivamente).
• Certifique-se de que os ficheiros de arquivo e cópia de
segurança do equipamento estão protegidos contra qualquer
acesso não autorizado e contra desastres. Esta lista inclui a
localização de armazenamento remoto, sites de descoberta
de desastres e a transferência segura de ficheiros de cópia de
segurança.
• Se possível, utilize uma firewall para restringir o tráfego na rede.
• Podem ser utilizadas pens USB para realizar e restaurar
diferentes tipos de cópias de segurança. A utilização incorreta
destas pens USB pode ter como resultado a perda de dados ou
uma avaria do equipamento.
• Utilize apenas pens USB que tenham sido testadas e instaladas
pela assistência técnica da Roche local.
• Só pode ser utilizado um dispositivo USB de cada vez. Antes
de introduzir uma pen USB, verifique se não está a ser utilizado
mais nenhum dispositivo USB.
• Antes de remover uma pen USB, escolha o botão Eject (Ejetar)
no Windows.
Proteção de dados
• A configuração predefinida do sistema operativo (SO) fornecida
com o servidor não deve ser alterada, porque se for isso terá
implicações nas configurações do SO com proteção.
• Para impedir que o uPath enterprise software seja infetado
por um vírus, utilize a pen USB única e exclusivamente nesse
equipamento. Não armazene outros dados nesta pen USB.
8 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Fluxo de trabalho de utilização do algoritmo uPath HER2 (4B5)
Materiais fornecidos
• Algoritmo uPath HER2 (4B5)
Materiais necessários, mas não fornecidos
• uPath enterprise software
• Lâminas de tecido mamário coradas com o anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5) utilizando o ultraView Universal DAB Detection
Kit corado num equipamento BenchMark ULTRA.
• Digitalizador de lâminas VENTANA DP 200
Avisos e precauções
1. Para utilização em diagnóstico in vitro (IVD).
2. Apenas para utilização profissional.
3. ATENÇÃO: nos Estados Unidos, a Lei Federal restringe a venda deste dispositivo a um médico ou mediante receita médica. (Rx Only)
4. Para reportar incidentes graves suspeitos relacionados com este dispositivo, contacte o representante local da Roche e a autoridade
competente do Estado Membro ou do País onde o utilizador está estabelecido.
Fluxo de trabalho
1. O tecido mamário depositado numa lâmina de vidro é corado com o anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5) utilizando um
equipamento BenchMark ULTRA.
2. É efetuada a aquisição de imagem (digitalização de toda a lâmina) com o digitalizador de lâminas VENTANA DP 200 utilizando uma
ampliação de 20x num plano z.
3. Depois de adquiridas, as imagens digitais são transferidas do computador associado ao digitalizador de lâminas VENTANA DP 200
para o sistema de gestão de imagens (Image Management System, IMS) num servidor centralizado.
4. A seguir à transferência para o servidor, é criado um caso no uPath enterprise software. A criação do caso pode ocorrer
automaticamente, através de comunicação com o sistema de informações laboratoriais (LIS), utilizando as informações de
identificação (i.e., tipo de tecido e anticorpo primário) contidas na etiqueta de código de barras da lâmina, ou através de introdução
manual no uPath enterprise software. Consulte o Guia do utilizador do uPath enterprise software (PN 1018943PT).
5. Se o algoritmo uPath HER2 (4B5) estiver instalado (tem de estar instalado num servidor diferente do uPath enterprise software e
do IMS) e for aceite uma imagem ampliada 20x com a coloração e o tipo de tecido apropriado, o uPath enterprise software aciona
automaticamente a análise da lâmina completa (Whole Slide Analysis, WSA).
6. A WSA analisa automaticamente toda a imagem digitalizada.
7. Uma vez concluída a WSA, o patologista é notificado dentro da visualização do uPath enterprise software através de uma barra azul
com a mensagem "analysis successful" (análise bem-sucedida).
8. O patologista pode selecionar ROI específicas para pontuar utilizando as ferramentas ROI e Exclusion (Exclusão) dentro do uPath
enterprise software.
9. O patologista revê os resultados da análise da imagem e aceita a pontuação ou substitui-a manualmente.
Coloração
• A preparação e a coloração do tecido devem ser feitas de acordo com as recomendações da folha de métodos do anticorpo VENTANA
anti-HER2/neu (4B5).
9 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
• Todos os controlos adequados deverão ser revistos e as lâminas deverão ser recoradas se a coloração não cumprir as linhas de
orientação enunciadas na folha de métodos do anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5).
• O algoritmo uPath HER2 (4B5) requer que seja utilizado o anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5), bem como quaisquer materiais ou
abastecimentos adicionais referidos na folha de métodos do anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5), para efetuar a coloração dos
tecidos antes da análise.
• O anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5) deteta a proteína HER2 em tecido mamário FFPE corado com o ultraView Universal DAB
Detection Kit num equipamento BenchMark ULTRA.
Captura de imagens
Para digitalizar as lâminas, é necessário um digitalizador de lâminas VENTANA DP 200. As imagens têm de ser digitalizadas com
uma ampliação de 20x. Recomenda-se que o tecido não tenha dobras nem tinta. Se houver secções grandes da imagem que estejam
desfocadas, recomenda-se que as lâminas sejam digitalizadas novamente. Para mais informações sobre o processo de digitalização,
consulte o Guia do utilizador IVD do digitalizador de lâminas VENTANA DP 200 (PN 1017149PT).
Navegação geral: uPath enterprise software
O uPath enterprise software destina-se a ser personalizado em função das necessidades individuais e da instituição, incluindo,
sem limitações, a configuração de relatórios e a interface de utilizador. Este guia do algoritmo irá concentrar-se nas ferramentas
necessárias à utilização apenas do algoritmo uPath HER2 (4B5). Para mais informações sobre o uPath enterprise software, consulte o
Manual do utilizador do uPath enterprise software.
10 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Fluxo de trabalho do patologista
Abrir um caso no uPath Enterprise Software
Para aceder a imagens de tecido mamário corado com o anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5), faça duplo clique num caso ou
selecione um caso e prima o separador Viewer (Visualização) (Figura 1).
É apresentado um ecrã com todas as imagens associadas a um caso (Figura 2).
Figura 2
Figura 1
11 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Depois de uma lâmina corada com o anticorpo VENTANA anti-HER2/neu (4B5) ser digitalizada num digitalizador de lâminas
VENTANA DP 200 com uma ampliação de 20x, a imagem é importada para o uPath enterprise software e associada a um caso. O
algoritmo uPath HER2 (4B5) aciona automaticamente a WSA. O tempo necessário para concluir o passo de pré-cálculo da WSA
depende das especificações do servidor, do tamanho da imagem e do número de imagens que estiverem em fila de espera. Se for
apresentada a mensagem "waiting to start auto-analysis" (a aguardar para iniciar a análise automática), isso significa que as imagens
estão na fila e ainda não foram analisadas. Se for apresentada a mensagem "analyzing" (a analisar), isso significa que está a ser
executada a WSA (Figuras 3 e 4).
Depois de a imagem ter sido completamente analisada via WSA no uPath enterprise software, é apresentada a mensagem "analysis
successful" (análise bem-sucedida) por baixo da imagem da lâmina no Viewer (Visualização) (Figura 5). Não é possível pontuar as
imagens antes de a WSA ser concluída com êxito.
Figura 5
Figura 4
Figura 3
12 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Desenhar a(s) ROI do total do tumor: selecionar a área do tumor
Utilize o botão da ferramenta Freehand (Mão livre) no menu pendente ROI (Figura 6) para selecionar a(s) área(s) do tumor na imagem
da lâmina corada IHQ que vai ser analisada. A Figura 7 ilustra uma imagem com uma única ROI desenhada. É possível desenhar mais
ROI. Cada área selecionada fará com que seja apresentada uma ROI no Slide Panel (Painel de lâminas) (Figure 8).
Figura 7
Figura 8
Figura 6
13 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Desenhar a(s) ROI do total do tumor: área de exclusão
Ao desenhar as ROI, pode ser necessário excluir algumas áreas. Na secção abaixo relativa às características de coloração, iremos
abordar áreas específicas que devem ser evitadas ou omitidas e apresentar exemplos. Utilize a ferramenta de exclusão Freehand
(Mão livre) do menu pendente Exclusion (Exclusão) (Figura 9) para excluir áreas específicas (Figura 10). Se houver grandes áreas da
imagem enevoadas ou desfocadas, digitalize novamente a lâmina.
As áreas excluídas não serão analisadas pelo algoritmo uPath HER2 (4B5), e as células tumorais coradas e não coradas dentro desta
área serão excluídas da área de análise total. Se a ROI já tiver sido analisada e for utilizada uma exclusão, a ROI terá de ser reanalisada
e a sobreposição será devidamente atualizada.
Desenhar um grande número de exclusões, especialmente de exclusões complicadas desenhadas com a ferramenta Freehand (Mão
livre), pode ser moroso e ter impacto na eficiência do fluxo de trabalho, tendo apenas um impacto marginal na pontuação final. Se um
caso necessitar de um grande número de exclusões, o patologista deve
• Desenhar várias ROI e excluir porções de tecido que considere não pontuáveis utilizando o mínimo possível a ferramenta Exclusion
(Exclusão).
• Limitar as exclusões e substituir manualmente a pontuação por outra pontuação.
Desenhar a(s) ROI do total do tumor: eliminação
Se uma ROI do total do tumor selecionada não for de qualidade ótima, pode ser eliminada. Selecione a ROI do total do tumor clicando no
centro da ROI na imagem e depois clicando no botão Delete (Eliminar) dentro do Slide Panel (Painel de lâminas) (Figura 11) ou dentro
da imagem da lâmina, próximo da ROI (Figura 12). Será apresentada uma janela de confirmação. Selecione Confirm (Confirmar) para
eliminar a ROI selecionada. Selecione Cancel (Cancelar) para manter a ROI.
Figura 9
Figura 11
Figura 12
Figura 10
14 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Depois de desenhadas todas as ROI do total do tumor e/ou áreas de exclusão, a imagem está pronta para ser analisada. Selecione a ROI
do total do tumor clicando no centro da ROI que vai ser analisada ou clicando na ROI no Slide Panel (Painel de lâminas). Para cada ROI,
clique no botão Image Analysis (Análise de imagem) dentro do Slide Panel (Painel de lâminas) (Figura 13) ou ao lado da ROI (Figura 14).
Assim que a análise de HER2 estiver concluída, o resultado é apresentado no Slide Panel (Painel de lâminas) em dois sítios: por baixo
da Slide Score (Pontuação da lâmina) e ao lado das ROI (Figura 15). A Slide Score (Pontuação da lâmina) baseia-se na soma dos
estados de HER 2 em todas as ROI selecionadas, e será esta a pontuação que vai ser apresentada no relatório.
É também possível ver informações mais detalhadas no ecrã detalhado Slide Score (Pontuação da lâmina) e no ecrã detalhado ROI
Details (Detalhes da ROI) clicando no ícone de apresentação detalhada (Figura 16). Aparece a apresentação detalhada da Slide Score
(Pontuação da lâmina) (Figura 17). Para ocultar estas informações, clique novamente no mesmo ícone.
Figura 15
Figura 17
Figura 16
Figura 13
Figura 14
15 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
Análise de imagem de HER2: sobreposição de cor
Depois de ter sido premido o botão ROI(s) Analysis (Análise de ROI) e de o tecido ter sido analisado, é aplicada uma sobreposição
de cor sobre a ROI. Na imagem abaixo (Figura 18), a sobreposição vermelha representa membranas celulares que se determinou
terem coloração positiva para HER2. Quando se agarra na imagem (clicando com o botão esquerdo do rato e movendo a imagem) a
sobreposição desaparece (Figura 19). Quando se deixa de premir o botão do rato, a sobreposição reaparece (Figura 18).
Figura 18
Figura 19
16 Guia do algoritmo de análise de imagens da mama uPath HER2 (4B5)
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Roche uPath HER2 (4B5) image analysis for Breast Algorithm Manual do usuário
- Tipo
- Manual do usuário
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